Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkd1Q99MH6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms