Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gtpbp4Q99ME9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms