Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1b4Q99ME6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms