Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca3Q99M54 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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