Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cstf3Q99LI7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms