Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TriobpQ99KW3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms