Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmp1Q99KU0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms