Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab28Q99KL7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms