Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf11Q99JX1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf11Q99JX1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms