Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krcc1Q99JT5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms