Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pacsin3Q99JB8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms