Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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Smim11aQ99J19 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Smim11aQ99J19 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Smim11aQ99J19 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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