Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn16Q925N4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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