Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn1Q922Y1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms