Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TardbpQ921F2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms