Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx4Q91YJ2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms