Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms