Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trpm2Q91YD4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm2Q91YD4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms