Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms