Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usb1Q91W78 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms