Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NifkQ91VE6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms