Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn8Q91VA3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn8Q91VA3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms