Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms