Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc92Q8VDN4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc92Q8VDN4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms