Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpcsQ8VDG5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms