Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med17Q8VCD5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med17Q8VCD5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms