Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Vmn1r200Q8R281 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Vmn1r200Q8R281 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Vmn1r200Q8R281 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r200Q8R281 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Vmn1r200Q8R281 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Vmn1r200Q8R281 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Vmn1r200Q8R281 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Vmn1r200Q8R281 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Vmn1r200Q8R281 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r200Q8R281 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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