Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1M2

H2afj, Histone H2A.J, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afjQ8R1M2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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H2afjQ8R1M2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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H2afjQ8R1M2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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H2afjQ8R1M2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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H2afjQ8R1M2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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H2afjQ8R1M2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afjQ8R1M2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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