Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin28aQ8K3Y3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms