Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OptnQ8K3K8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OptnQ8K3K8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms