Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms