Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms