Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c1Q8K284 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms