Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms