Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cldn34c1Q8K193 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cldn34c1Q8K193 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cldn34c1Q8K193 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cldn34c1Q8K193 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn34c1Q8K193 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn34c1Q8K193 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Cldn34c1Q8K193 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c1Q8K193 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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