Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms