Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CopaQ8CIE6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CopaQ8CIE6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CopaQ8CIE6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CopaQ8CIE6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CopaQ8CIE6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms