Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnka2ipQ8CH19 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnka2ipQ8CH19 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms