Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc87Q8CDL9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms