Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lancl3Q8CD19 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lancl3Q8CD19 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms