Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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