Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slfn5Q8CBA2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn5Q8CBA2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms