Protein–RNA interactions for Protein: Q8C966

Phf21b, PHD finger protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf21bQ8C966 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf21bQ8C966 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf21bQ8C966 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms