Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7cQ8C6E1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms