Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z3

Ssxb2, Synovial sarcoma, X member B2, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb2Q8C5Z3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms