Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc90bQ8C3X2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms