Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3W1

Uncharacterized protein C1orf198 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3W1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C3W1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C3W1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C3W1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C3W1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms