Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gpcpd1Q8C0L9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpcpd1Q8C0L9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms