Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FarsaQ8C0C7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms