Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY35

Fgd2, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd2Q8BY35 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgd2Q8BY35 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgd2Q8BY35 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms